Los Órganos de representación, gobierno y administración de la Asociación son la Asamblea General, la Junta Directiva y la Presidenta, que actúan bajo los principios de pluralidad y organización democrática.
La Junta Directiva se compone actualmente por la presidenta de la asociación y diez vocales, elegidos por los socios en Asamblea mediante sufragio libre y secreto por periodos de cuatro años. Dos de ellos son vicepresidentes por designación de la Junta Directiva. También forma parte de la misma el Director Gerente de la Asociación.
Asimismo, ANCI cuenta con Grupos de Trabajo y Comisiones Técnicas sobre diversas áreas de interés para los asociados. Las Comisiones constituidas en la actualidad son las siguientes:
- Contratación Pública
- Colaboración Público-Privada
- Comunicación
- Construcción 4.0
- ESG (Sostenibilidad)
- Legal